高通量測序(High-Throughput Sequencing)又名下一代測序(Next Generation Sequencing,NGS),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。
檢測過程:
1.樣本準備(sample fragmentation)
2.文庫構建(library preparation)
3.測序反應(sequencing reaction)
本平臺提供的服務:
轉錄組測序
又稱RNA-seq,轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的mRNA,通過新一代高通量測序,能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息。
Small RNA測序
小RNA是一類重要的體內調節分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。小RNA測序技術采用膠分離技術,收集樣品中18-30nt的RNA片段,利用高通量測序技術,一次性獲得單堿基分辨率的數百萬條小RNA序列信息,依托強大的生物信息分析平臺,鑒定已知小RNA,并預測新的小RNA及其靶標基因。
LncRNA測序
lncRNA(長鏈非編碼RNA,long non-coding RNA,lncRNA)測序也稱為全轉錄組測序,與普通的通過polyA富集方法的轉錄組測序不同的是,lncRNA測序是通過rRNA去除法從而對含有polyA尾和不含有polyA尾的RNA一同富集建庫測序。
circRNA測序
環狀RNA(circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分子,呈封閉環狀結構,不受RNA外切酶影響,表達更穩定,不易降解。由于circRNA的閉合環狀特性,通過去除total RNA中的rRNA和線性RNA分子,可以特異地富集circRNA分子后測序,更有針對性地分析受檢樣本中特定的circRNA譜、circRNA剪接模式、組間差異和功能等。
基因組重測序
人全基因組重測序是基于人基因組參考序列對個體或群體進行全基因組測序,并在個體或群體水平進行生物信息分析,從而進行個體或群體的基因組的差異性。
宏基因組測序
宏基因組學(Metagenomics)又叫微生物環境基因組學、元基因組學。它通過直接從環境樣品中提取全部微生物的DNA,構建宏基因組文庫,利用基因組學的研究策略研究環境樣品所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能。
16s/18s/ITS測序
16S/18S/ITS等擴增子測序,也稱微生物多樣性測序,即通過提取環境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的某一或某幾個區,通過檢測目的區域的序列變異和豐度,對環境樣本物種分類及豐度,種群結構,系統進化,群落比較等方面信息進行分析的研究方法。16S rDNA是細菌分類學研究中最常用的“分子鐘”,真菌可以采用18S rDNA測序的方法進行菌種鑒定。
美軒優勢
●
極強地處理復雜樣本的能力
● 豐富的建庫經驗,加入文庫均一化技術
● 最佳的測序解決方案和快速的分析平臺
● 全面和高質量的基因解析結果
擁有多種測序平臺和強大的計算機資源,提供最佳的測序解決方案和快速的分析平臺;
擁有專業的分析團隊,全面的分析內容,提供全面和高質量的基因組解析結果;
客戶提供
樣本,要求如下:
樣品類型 |
樣品要求 |
血液 |
2ml(DNA)-5ml(RNA)以上新鮮或凍存的抗凝血,或從全血中提取的白細胞,推薦使用EDTA抗凝劑,不要使用肝素抗凝 |
組織 |
動物組織500mg(RNA)-1g(DNA)以上,植物組織2g以上 |
細胞 |
1*107個以上 |
16s/18s測序 |
常規樣本2g以上沉淀,水樣10ml以上,根據微生物豐度 |
宏基因組 |
常規樣本5g以上沉淀,水樣25ml以上,根據微生物豐度 |
做DNA方面,需冰袋運輸;做RNA方面,樣本中需加trizol,干冰運輸。
美軒提供
1、完整詳盡的實驗報告;
2、實驗中所涉及的圖片、數據;
3、實驗結果分析。